علی خامنهای، رهبر جمهوری اسلامی در پیامی در واکنش به حملات اسرائیل بر ایران نوشت که اسرائیل «دست پلید و خونآلود خود را به جنایتی در کشور عزیزمان گشود.»
خامنهای گفت که اسرائیل باید «منتظر مجازاتی سخت باشد.» او تاکید کرد که «دست قدرتمند نیروی مسلح جمهوری اسلامی» اسرائیل را رها نخواهد کرد.
رهبر جمهوری اسلامی همچنین گفت که اسرائیل به نقاط مسکونی حمله کرده است.
علی خامنهای گفت اسرائیل «با این جنایت، برای خود سرنوشت تلخ و دردناکی تدارک دید و آن را قطعاً دریافت خواهد کرد.»
در این حمله شماری از مقامهای علمی، سیاسی و نظامی ایران از جمله فرمانده کل سپاه پاسداران کشته شده است.